Указом главы государства Ирине Карнаковой присвоено почётное звание «Заслуженный экономист Российской Федерации». Основанием названы заслуги в области экономики и финансов и многолетняя добросовестная работа.
Карнакова возглавляет Контрольно-счётную палату Вологодской области с апреля 2014 года.